Veškeré činnosti, včetně léčby, probíhají v pěti bezbariérových pavilonech, které jsou vzájemně propojeny koridory, proto je léčba vhodná pro pacienty s poruchami lokomoce (hole, berle, vozík).
Celková kapacita ubytování je 161 lůžek.
Pokoje
Pokoje jsou vybaveny televizorem se satelitním příjmem a chladničkou. Ubytování v jednolůžkových pokojích je poskytováno jako nadstandardní. Většina pokojů má vlastní sociální zařízení, v některých pokojích je sociální zařízení společné pro dva pokoje.
Internetové WiFI připojení zdarma je k dispozici v prostorech klubu pavilonu A a pavilonech C1, B.
Ve Vojenském rehabilitačním ústavu Slapy nad Vltavou není povolen pobyt domácích zvířat, mimo psů se speciálním výcvikem podle zákona č. 372/2011 Sb. Informaci o doprovodu a přítomnosti psa se speciálním výcvikem uvede pacient v žádosti o přijetí do Vojenského rehabilitačního ústavu Slapy nad Vltavou zpracované vysílajícím lékařem.
Pro parkování osobních vozidel lze za poplatek využít odstavnou plochu přímo v areálu VRÚ.
